A csakrák a test energia központjai, amelyek a "Kundalini" energiát más, a szervezetnek jobban megfelelő alakba alakítják át, de saját magunk nem tartalmaznak energiát. A "Kundalini" energia az a tiszta energia, amely áthatja az egész világegyetemet.

A csakrák a testhez a különböző mirigyeken és idegdúcokon keresztül kapcsolódnak. A csakráknak egész rendszerét térképezte fel az ókori távol keleti orvostudomány. 3 legfőbb , 4 fő, és 300-nál több kisebb csakra található az emberi testben. A csakrák térképét évezredeken keresztül használták a keleti gyógyításban.

A főbb csakrák:

Gyökér csakra (Muladhara)

A fizikai világhoz kapcsolódó legalsó csakra, amely az aura legalsó, úgynevezett étertest rétegéhez kapcsolódik. Ez az étertest a fizikai test tervrajza, amely meghatározza az atomok helyét. A gyökércsakra színe a vörös, és a mellékvese mirigy működésére hat. Az itt beáramló energia a gerincoszlopot és a vese környékét látja el energiával.

Keresztcsonti vagy lép csakra (Svadhishthana)

A második csakra az aura érzelmi test rétegéhez kapcsolódik, amely az érzelmeinknek megfelelően változó színű foltokat tartalmaz. Ennek a csakrának a színe a narancsvörös. A keresztcsonti csakra a nemzőszervekkel van kapcsolatban.

Napfonat csakra (Manipura)

A harmadik csakra az aura mentális test rétegéhez kapcsolható. Ez a réteg a gondolatok és mentális folyamatok tároló helye. Itt alakulnak a gondolataink energetikai mintái. Ezek a többnyire ragyogó sárga színű minták a fej körül hoznak létre glóriát, de az egész testünket is körül veszi. A napfonat csakra színe a sárga és a gyomor környékén lévő szerveket befolyásolja.

Az eddig felsorolt három alsó csakra és auraréteg a fizikai világban létező energiarendszerek, amelyek szoros kapcsolatban vannak a látható fizikai testünkkel.

Szívcsakra (Anahata)

A negyedik csakra az asztrális réteghez kapcsolódik. Ez a réteg egyfajta átjáró, ötvözete az alsó három és a felső három rétegnek. Az asztráltest köti össze a fizikai jellegű rétegeket a szellemi, lelki jellegű rétegekkel, ezért ez a réteg sokkal mozgékonyabb az alsó háromnál. A szívcsakrában nagy energiák mozognak, de nem csak az aurán belül. Ide kapcsolódik a szeretet energiája és érzése, ezért az egymást szerető emberek az asztráltestüket energiaszálakkal kötik össze, a kapcsolat megszűnésekor ezek a szálak szakadnak meg. A szívcsakra színe a zöld és a szívhez kapcsolódó szervekre van hatással.

Torokcsakra (Vishuddha)

Az ötödik csakra az ún. éteri minta rétege. Ez már nem anyagi szint, az étertest eredeti tervét tartalmazza. Ez az a tökéletes terv, amely alapján a fizikai szint elkészül. Betegségek, torzulások során ezt a réteget kell kijavítani, hogy innen lefelé átadódhasson az eredeti tiszta információ a fizikai testnek. A torokcsakra színe kék és a torok környéki szervekre van hatása.

Harmadik szem csakra (Ajna)

A hatodik csakra a mennyei testhez kapcsolódik. A mennyei testünk segítségével - meditáció közben - képesek vagyunk kapcsolatot teremteni az univerzum spirituális lényeivel, más emberek lelkével, a magasabb énnel. Ez a csakra indigókék színű és az agyalapi mirigyhez kötődik.

Koronacsakra (Sahasrara)

A hetedik csakra a keterikus szinttel van kapcsolatban. Ez a réteg rugalmas és erős, amely az alsóbb réteget is védi a külső energiáktól. Mérete egyénektől függően körülbelül egy méterrel terjedhet túl a fizikai testünkön. A koronacsakra nagy, aranyló tojáshéjhoz hasonló képződmény, és rendkívül magas frekvencián rezeg. A koronacsakra színe a fehér, hatása a tobozmirigyre van.


Mellékcsakrák

A testünkön számos kisebb csakra található még. Ezek közül jelentősebbek a két tenyér közepén és a két talp közepén lévő csakrák, amelyek kulcsszerepet kapnak a Reiki során. A Reiki beavatáskor a tanítvány koronacsakrájától a szívcsakrán keresztül a két tenyér csakrájáig egy csatornát hangol be a mester. Ezen a csatornán azután a beavatott bármikor annyi energiát képes közvetíteni, amennyire szükség van. Ez a csatorna lehetővé teszi azt is, hogy a beavatott személy is részesüljön a rajta keresztül áramló energiából.

A testünket körül ölelő energia rendszerünk része a csakrák, melyek közül a 7 legfontosabb: gyökér csakra, szex csakra, napfonat csakra, szív csakra, torok csakra, harmadik szem csakra, korona csakra.
Az alsó 3 csakra a Földi síkhoz kapcsolódik, míg a felső három a szellemi világhoz. a köztük elhelyezkedő szív csakra pedig összeköti őket.
Sokan keresik szellemi útjukat, de soha sem szabad csak az egyik csakrára fókuszálni. Gyakran okoz problámát, hogy még a szellemi tanítók között is van olyan aki csak a felső csakrák fejlődésére fókuszál,és az alsóbb,fölhöz kapcsolódó csakrák működését mellőzi tanításaiból. Ez a hiba azonban a mi fizikai síkunkon szinte azonnal érzékelhető, mert a "földtől való elrugaszkodás a személy és energia rendszere felborulását okozza.